RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3EA0A087X179 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 C10orf142B7Z368 130 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3LB9A6J9 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TOR1BO14657 336 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SPINT1O43278 529 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 EPN2O95208 641 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KCNK5O95279 499 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SEMA4FO95754 770 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3HP0C7X1 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PIRTP0C851 137 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 C6P13671 934 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CRADDP78560 199 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SGCGQ13326 291 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ACOX1Q15067 660 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KYNUQ16719 465 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 DENND2CQ68D51 928 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MRNIPQ6NTE8 343 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CERS6Q6ZMG9 384 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CROCCP2Q86T23 111 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 GPR150Q8NGU9 434 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 GAB3Q8WWW8 586 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ULK4Q96C45 1275 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 DTD2Q96FN9 168 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TCF12Q99081 682 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FAM167BQ9BTA0 163 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NINJ2Q9NZG7 142 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FETUBQ9UGM5 382 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 DMTF1Q9Y222 760 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.66□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 AURKAO14965 403 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 RIPK2O43353 540 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 LATO43561 262 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NDUFS2O75306 463 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 PRKCGP05129 697 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 C1SP09871 688 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 BPIP17213 487 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 NMBRP28336 390 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MGAT5Q09328 741 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 STAT4Q14765 748 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ZNF284Q2VY69 593 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 GALNT7Q86SF2 657 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN33Q86UF1 283 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 IGDCC3Q8IVU1 814 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 OR4L1Q8NH43 312 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 FOXJ1Q92949 421 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 TCEAL3Q969E4 200 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 HDAC10Q969S8 669 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 EID2BQ96D98 161 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 MFSD3Q96ES6 412 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CERS2Q96G23 380 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 C9orf72Q96LT7 481 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 CYTH2Q99418 400 aa11.65□□□□□ -0.54
NISCH-211ENST00000488243 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms