RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481173.1

CCNL1-223, Transcript of cyclin L1, human

TSL 2

Gene CCNL1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-223	ENST00000481173	LDLRAD4	O15165	306 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	CRLF1	O75462	422 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	AMPH	P49418	695 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	GALNT2	Q10471	571 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	BEST3	Q8N1M1	668 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	OR5R1	Q8NH85	324 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF524	Q96C55	264 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	HVCN1	Q96D96	273 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	GGA3	Q9NZ52	723 aa		3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNHIT1	O43257	154 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TERF1	P54274	439 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FOXM1	Q08050	763 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF234	Q14588	700 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	GPR68	Q15743	365 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TTI2	Q6NXR4	508 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	OR52I2	Q8NH67	350 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	KLHL29	Q96CT2	875 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	LINGO1	Q96FE5	620 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	QRFPR	Q96P65	431 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	LITAF	Q99732	161 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FKRP	Q9H9S5	495 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PADI3	Q9ULW8	664 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PTPRC	P08575	1304 aa		3.08	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TAF4	O00268	1085 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TSPAN4	O14817	238 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SPINT2	O43291	252 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	GABRB2	P47870	512 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	HSD17B4	P51659	736 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TAS2R38	P59533	333 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FGFBP1	Q14512	234 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ALG11	Q2TAA5	492 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	VEZT	Q9HBM0	779 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	KCND2	Q9NZV8	630 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	MPP6	Q9NZW5	540 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	UTY	O14607	1347 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CTAGE9	A4FU28	777 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	LRRC53	A6NM62	1247 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TUBB	P07437	444 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PATE4	P0C8F1	98 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	CTAGE8	P0CG41	777 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PAX1	P15863	534 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	IL7R	P16871	459 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	PAFAH1B1	P43034	410 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TUBB4B	P68371	445 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	COG7	P83436	770 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	TLE2	Q04725	743 aa		3.06	□□□□□ -1.92
CCNL1-223	ENST00000481173	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92

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