RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TRIM74Q86UV6 250 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa20.83■□□□□ 0.93
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ACTB-211ENST00000480301 METTL18O95568 372 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A1P02730 911 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 BPIP17213 487 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 HMGCLP35914 325 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 DCDC1P59894 354 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 PARP6Q2NL67 630 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 DOK6Q6PKX4 331 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 GKN2Q86XP6 184 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 RTP4Q96DX8 246 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 APOL2Q9BQE5 337 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CDH19Q9H159 772 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 RAD18Q9NS91 495 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 HACD3Q9P035 362 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SUFUQ9UMX1 484 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.82■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 IVLP07476 585 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CDK4P11802 303 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ALS2CLQ60I27 953 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SLC35F3Q8IY50 421 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SPEGQ15772 3267 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN12O43309 604 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 GNPDA1P46926 289 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CLDN6P56747 220 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SPARCL1Q14515 664 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 KCTD11Q693B1 232 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 NRROSQ86YC3 692 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 IL17CQ9P0M4 197 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 GPR34Q9UPC5 381 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.8■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CEP104O60308 925 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 FGGP02679 453 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CXCR5P32302 372 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 SNX1Q13596 522 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 NR0B2Q15466 257 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CCNG2Q16589 344 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 P3H1Q32P28 736 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.79■□□□□ 0.92
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ACTB-211ENST00000480301 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 VPS18Q9P253 973 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ST14Q9Y5Y6 855 aa20.79■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CPED1A4D0V7 1026 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC6O75061 913 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 USP12O75317 370 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ASMTLO95671 621 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 GP1BAP07359 652 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 ADCY8P40145 1251 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 RPIAP49247 311 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 E2F1Q01094 437 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 CTBSQ01459 385 aa20.78■□□□□ 0.92
ACTB-211ENST00000480301 PYCR3Q53H96 274 aa20.78■□□□□ 0.92
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