RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469271.1

NOM1-203, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 1,209 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-203ENST00000469271 PDXPQ96GD0 296 aa20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PAK5Q9P286 719 aa20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SNX12Q9UMY4 172 aa20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.39■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 C2orf81A6NN90 581 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TRIM38O00635 465 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SIGLEC6O43699 453 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ANXA6P08133 673 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GKN2Q86XP6 184 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 COX14Q96I36 57 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 WDR24Q96S15 920 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.38■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 E7EVH7 732 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 AURKAO14965 403 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CRTAMO95727 393 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CEACAM5P06731 702 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 IVLP07476 585 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 BPIP17213 487 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CKMT2P17540 419 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GNG11P61952 73 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PROX2Q3B8N5 592 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GPR26Q8NDV2 337 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GLMNQ92990 594 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 AGAP2Q99490 1192 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 APOL2Q9BQE5 337 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 KCND1Q9NSA2 647 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 IL17CQ9P0M4 197 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 VPS18Q9P253 973 aa20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 INPP4BO15327 924 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GPR89BP0CG08 455 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GIMD1P0DJR0 217 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SPAM1P38567 509 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 LMAN1P49257 510 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ILKQ13418 452 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PEX6Q13608 980 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ALS2CLQ60I27 953 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PRELID2Q8N945 189 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CLPBQ9H078 707 aa20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 YY2O15391 372 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 STX7O15400 261 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 USP12O75317 370 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DKK1O94907 266 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 GAS8O95995 478 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CKMT1AP12532 417 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 RPIAP49247 311 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DAB2P98082 770 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 C1orf61Q13536 156 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SEMA5AQ13591 1074 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SPARCL1Q14515 664 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 DOK6Q6PKX4 331 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 COG1Q8WTW3 980 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 MS4A14Q96JA4 679 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 APOLD1Q96LR9 279 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 RMI1Q9H9A7 625 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SUFUQ9UMX1 484 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NOM1-203ENST00000469271 SUN1O94901 812 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.2 ms