RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 NDUFS3O75489 264 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 LSAMPQ13449 338 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 GRB7Q14451 532 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PAQR3Q6TCH7 311 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ABI1Q8IZP0 508 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SPON2Q9BUD6 331 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 DERL2Q9GZP9 239 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 GID8Q9NWU2 228 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 BTRCQ9Y297 605 aa18.25■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SYCE1LA8MT33 242 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SCNN1BP51168 640 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 KCNQ1P51787 676 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ATP6V0D1P61421 351 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 GNA12Q03113 381 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PRKCZQ05513 592 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 CYTH1Q15438 398 aa18.24■□□□□ 0.51
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SYNE4-204ENST00000465425 KRT80Q6KB66 452 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 METTL25Q8N6Q8 603 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 CANT1Q8WVQ1 401 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 LINC01599Q8WXQ3 324 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MGME1Q9BQP7 344 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SLC2A11Q9BYW1 496 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MAGEH1Q9H213 219 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 POLG2Q9UHN1 485 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ACTL7AQ9Y615 435 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 LCHNA4D1U4 455 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MTMR11A4FU01 709 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 VPS4BO75351 444 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 TIPRLO75663 272 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 IDO1P14902 403 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 CAPN3P20807 821 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 CST5P28325 142 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ANKS6Q68DC2 871 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 OR7D4Q8NG98 312 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 LRCH3Q96II8 777 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA17Q96L03 361 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 TRIB3Q96RU7 358 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM79Q9BSE2 394 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 NACA2Q9H009 215 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 TUBB1Q9H4B7 451 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MAP10Q9P2G4 905 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 AURKCQ9UQB9 309 aa18.24■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MOXD2PA6NHM9 499 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 C2orf81A6NN90 581 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 C9JVG2 144 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 NME4O00746 187 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 GIPC2Q8TF65 315 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.515e-7■■■■□ 23.5
SYNE4-204ENST00000465425 ARMC1Q9NVT9 282 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ABCD2Q9UBJ2 740 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MATN4O95460 622 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PYGLP06737 847 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ATP6V1B2P21281 511 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 NR1H2P55055 460 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 FAM189BP81408 668 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SREBF2Q12772 1141 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 INPP5AQ14642 412 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ADRM1Q16186 407 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 USP41Q3LFD5 358 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 EXOC2Q96KP1 924 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PSKH2Q96QS6 385 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 PADI4Q9UM07 663 aa18.23■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 GIPC1O14908 333 aa18.22■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 ECI2O75521 394 aa18.22■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 CHEK2O96017 543 aa18.22■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 OXCT1P55809 520 aa18.22■□□□□ 0.51
SYNE4-204ENST00000465425 BNIP2Q12982 314 aa18.22■□□□□ 0.51
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