RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-210ENST00000462125 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-210ENST00000462125 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-210ENST00000462125 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
C9orf3-210ENST00000462125 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ADAMTS20P59510 1910 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 GOLGA6CA6NDK9 693 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 GOLGA6BA6NDN3 693 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 RCCD1A6NED2 376 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 BTNL10A8MVZ5 291 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 GOLGA6DP0CG33 693 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PTPN3P26045 913 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 GNPDA1P46926 289 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 CTBSQ01459 385 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 CDK18Q07002 472 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 WASHC5Q12768 1159 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PEX6Q13608 980 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PYCR3Q53H96 274 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 FAM182AQ5T1J6 154 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SPC24Q8NBT2 197 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 CCHCR1Q8TD31 782 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 P3H4Q92791 437 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SLC46A1Q96NT5 459 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ASCL3Q9NQ33 180 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 TAAR2Q9P1P5 351 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 LRIT1Q9P2V4 623 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SATB2Q9UPW6 733 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 RNF215Q9Y6U7 377 aa13.14□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SOWAHDA6NJG2 315 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 MTSS1O43312 755 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 EPOP01588 193 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 AK4P27144 223 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 COPS2P61201 443 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 B4GALNT1Q00973 533 aa13.13□□□□□ -0.31
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C9orf3-210ENST00000462125 NR1D2Q14995 579 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PPP2R5EQ16537 467 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 KAZNQ674X7 775 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 RAD9BQ6WBX8 426 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF438Q7Z4V0 828 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 DAAM2Q86T65 1068 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ARL14Q8N4G2 192 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA22Q8NHS9 363 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 KRT35Q92764 455 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 VAT1Q99536 393 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 CDH19Q9H159 772 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PKD2L2Q9NZM6 624 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 SEPT10Q9P0V9 454 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 VPS18Q9P253 973 aa13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 DUSP10Q9Y6W6 482 aa13.13□□□□□ -0.31
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C9orf3-210ENST00000462125 FADS2P1A8MWK0 482 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 HACD1B0YJ81 288 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 B4DGG1 531 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 D6RAR5 112 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 PJA2O43164 708 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 B4GAT1O43505 415 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 DNAJC6O75061 913 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ECEL1O95672 775 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 NDST3O95803 873 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 ITPKBP27987 946 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 CCKBRP32239 447 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 MARCKSL1P49006 195 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 XRCC4Q13426 336 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 LRP8Q14114 963 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 GALNT3Q14435 633 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 LLGL1Q15334 1064 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf3-210ENST00000462125 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.12□□□□□ -0.31
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