RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438547.6

SEMA4D-211, Transcript of semaphorin 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEMA4D, Length 4,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4D-211ENST00000438547 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 UGT2B11O75310 529 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TCF4P15884 667 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ICAM3P32942 547 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 GPD2P43304 727 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ATP12AP54707 1039 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SMIM11AP58511 58 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 CLCQ05315 142 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 USP7Q93009 1102 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SHISA4Q96DD7 197 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF358Q9NW07 568 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 VPS4AQ9UN37 437 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 H6PDO95479 791 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 IL23RQ5VWK5 629 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 PPTC7Q8NI37 304 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF671Q8TAW3 534 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 RASSF1Q9NS23 344 aa11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
SEMA4D-211ENST00000438547 COL1A2P08123 1366 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 OR10H3O60404 316 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 BMP10O95393 424 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 QPRTQ15274 297 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GALNT5Q7Z7M9 940 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CDH24Q86UP0 819 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 KLRG1Q96E93 195 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GPR21Q99679 349 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TRIM39Q9HCM9 518 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PPM1HQ9ULR3 514 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 KCNE2Q9Y6J6 123 aa11.15□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC22A2O15244 555 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TBL1XO60907 577 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GUCY1B2O75343 617 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 NDST3O95803 873 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 FTH1P02794 183 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CHRNGP07510 517 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 HDCP19113 662 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GPX6P59796 221 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 OLR1P78380 273 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF460Q14592 562 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TREML2Q5T2D2 321 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CYP20A1Q6UW02 462 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 LBX2Q6XYB7 198 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF570Q96NI8 536 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 LRTM1Q9HBL6 345 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CCL22O00626 93 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 BCKDKO14874 412 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 HAT1O14929 419 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PLSCR1O15162 318 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 RGS10O43665 173 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ANGPTL1O95841 491 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 CFHP08603 1231 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC6A2P23975 617 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 IGFBP5P24593 272 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 NTSP30990 170 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ASPAP45381 313 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 MBTD1Q05BQ5 628 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 PITRM1Q5JRX3 1037 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 DOK6Q6PKX4 331 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ZNF438Q7Z4V0 828 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SSR3Q9UNL2 185 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 MATN3O15232 486 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 ITM2AO43736 263 aa11.14□□□□□ -0.63
SEMA4D-211ENST00000438547 TSPAN1O60635 241 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms