RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 VPS18Q9P253 973 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CHKBQ9Y259 395 aa20.87■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0U1RQS6 177 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 EFSO43281 561 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF10O60809 474 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K6O95382 1288 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G2AP14555 144 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CD1CP29017 333 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH4A1P30038 563 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ETV5P41161 510 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ACTR1BP42025 376 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 FASLGP48023 281 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ACTR1AP61163 376 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 DOK6Q6PKX4 331 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 DTX1Q86Y01 620 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PATE1Q8WXA2 126 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM14Q96QK8 99 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC7Q99615 494 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.86■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf172C9J069 976 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM253P0C7T8 217 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 KDELR1P24390 212 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 LIMK2P53671 638 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 GPLD1P80108 840 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 BIRC2Q13490 618 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM14Q14142 442 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 AMZ1Q400G9 498 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 USP7Q93009 1102 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 MED8Q96G25 268 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RNF157Q96PX1 679 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 AGAP2Q99490 1192 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.85■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.84■□□□□ 0.93
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LIMS1-208ENST00000428064 MMP2P08253 660 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TGIF1Q15583 401 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM164Q5U3C3 297 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 XKR5Q6UX68 686 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM74Q86UV6 250 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 WDR24Q96S15 920 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.84■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC6O75061 913 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 THRAP10827 490 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PTMSP20962 102 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SPINT3P49223 89 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 MAPK10P53779 464 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 LY6DQ14210 128 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SFRP1Q8N474 314 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PLD5Q8N7P1 536 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CCNYQ8ND76 341 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RAPGEF5Q92565 580 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 SGF29Q96ES7 293 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 RMI1Q9H9A7 625 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.83■□□□□ 0.93
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF462Q96JM2 2506 aa20.83■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 COL6A6A6NMZ7 2263 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB2P05107 769 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CSF2RBP32927 897 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGAP25P42331 645 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 QPCTQ16769 361 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 MANEAQ5SRI9 462 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 USP53Q70EK8 1073 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CNTD1Q8N815 330 aa20.82■□□□□ 0.92
LIMS1-208ENST00000428064 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.82■□□□□ 0.92
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