RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TGDSO95455 350 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PGK1P00558 417 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNGP01579 166 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LYNP07948 512 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 KIR3DL1P43629 444 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GNPDA1P46926 289 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CLK3P49761 638 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GALK1P51570 392 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 DDR1Q08345 913 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP1CQ5VVH2 108 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MFSD5Q6N075 450 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HPS6Q86YV9 775 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPV1Q8NER1 839 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HELQQ8TDG4 1101 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC39A8Q9C0K1 460 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDH18Q9HCL0 1135 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 S100A14Q9HCY8 104 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RASSF1Q9NS23 344 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SOHLH2Q9NX45 425 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PLLPQ9Y342 182 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM86C2PA6NEL3 165 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 COL6A2P12110 1019 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CES1P23141 567 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MTTPP55157 894 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC36Q8IYA8 594 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HPS1Q92902 700 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 AKT1S1Q96B36 256 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAT2Q9BWD1 397 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 IRGMA1A4Y4 181 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF879B4DU55 563 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BNX3 289 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PLK4O00444 970 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GCATO75600 419 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TRMUO75648 421 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 THRBP10828 461 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PTPRAP18433 802 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 AQP1P29972 269 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MANFP55145 182 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPSQ13938 189 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 QPCTQ16769 361 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP69Q49AA0 526 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 THAP5Q7Z6K1 395 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM35AQ86V20 835 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HM13Q8TCT9 377 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HTRA1Q92743 480 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 BRD9Q9H8M2 597 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CAB39LQ9H9S4 337 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 EXD2Q9NVH0 621 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM4Q9UKN5 801 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SQORQ9Y6N5 450 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BNH8 94 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 FGBP02675 491 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP8P22894 467 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PAX3P23760 479 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MPSTP25325 297 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGDIBP52566 201 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CBX3Q13185 183 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CPTPQ5TA50 214 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3R6Q5UE93 754 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND1CQ8IV53 801 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 BSNDQ8WZ55 320 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 HAVCR1Q96D42 359 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC47A1Q96FL8 570 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 APOLD1Q96LR9 279 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 GLOD4Q9HC38 313 aa10.96□□□□□ -0.65
EFTUD2-202ENST00000426333 CARNS1A5YM72 827 aa10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms