RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424993.1

SNX18P3-201, Transcript of sorting nexin 18 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SNX18P3, Length 835 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18P3-201ENST00000424993 POM121BA6NF01 834 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CAPN8A6NHC0 703 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 K7ESM1 405 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PSMD11O00231 422 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ARHGAP33O14559 1287 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PCCBP05166 539 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 APRTP07741 180 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SYPP08247 313 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 MLNP12872 115 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF30P17039 623 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PSMA3P25788 255 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CD27P26842 260 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TMPRSS15P98073 1019 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 DR1Q01658 176 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 IRF4Q15306 451 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PPP1R7Q15435 360 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 JAMLQ86YT9 394 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 BBOF1Q8ND07 529 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CPT1BQ92523 772 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PEX13Q92968 403 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SCAMP4Q969E2 229 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CENPTQ96BT3 561 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 BMFQ96LC9 184 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 COQ10AQ96MF6 247 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 AGAP2Q99490 1192 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CAPN10Q9HC96 672 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 HACD3Q9P035 362 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF711Q9Y462 761 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ARL5AQ9Y689 179 aa7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SCN8AQ9UQD0 1980 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 KNL1Q8NG31 2342 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 A0A1W2PR77 199 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 MAGEB16A2A368 324 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CCL22O00626 93 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SCAMP1O15126 338 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 RAD51CO43502 376 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SH3BP5O60239 455 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PPFIA2O75334 1257 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 AVILO75366 819 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 FGF1P05230 155 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CA5AP35218 305 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 IGFALSP35858 605 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ADCY8P40145 1251 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 NPY2RP49146 381 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 STC1P52823 247 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CRADDP78560 199 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PDE1BQ01064 536 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SLC7A5Q01650 507 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 BNC1Q01954 994 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CAV1Q03135 178 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 LAMB3Q13751 1172 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 SEPT6Q14141 434 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 INPP5AQ14642 412 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 KCNJ11Q14654 390 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 STAT4Q14765 748 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 POU6F1Q14863 301 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 MORF4L2Q15014 288 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 LRRC14Q15048 493 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TRADDQ15628 312 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 CCDC38Q502W7 563 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 ALS2CLQ60I27 953 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 DUPD1Q68J44 220 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 GCNT7Q6ZNI0 430 aa7.55□□□□□ -1.2
SNX18P3-201ENST00000424993 Q6ZSR6 202 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms