RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 SRP54P61011 504 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
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HDLBP-210ENST00000423693 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa12.87□□□□□ -0.35
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HDLBP-210ENST00000423693 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 ITGA9Q13797 1035 aa12.86□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.353e-11■■■□□ 19.1
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HDLBP-210ENST00000423693 ALG11Q2TAA5 492 aa12.86□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
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HDLBP-210ENST00000423693 IL22Q9GZX6 179 aa12.86□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 SLC32A1Q9H598 525 aa12.86□□□□□ -0.35
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HDLBP-210ENST00000423693 CPT1BQ92523 772 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 GLYATL1Q969I3 302 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 CDC6Q99741 560 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 DUSP23Q9BVJ7 150 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 TRIM39Q9HCM9 518 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 SMOXQ9NWM0 555 aa12.85□□□□□ -0.35
HDLBP-210ENST00000423693 ASIC3Q9UHC3 531 aa12.85□□□□□ -0.35
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