RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM209Q96SK2 561 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HS3ST4Q9Y661 456 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PP18 115 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C9JVG2 144 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 K7EPI3 171 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR6P50406 440 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXM1Q08050 763 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB39AQ14964 217 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UPP1Q16831 310 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATS1Q496A3 300 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP2R1Q6VVX0 501 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NPLOC4Q8TAT6 608 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VMP1Q96GC9 406 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNA7Q96RP8 456 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0U1RQS6 177 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FUOMA2VDF0 154 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CIB2O75838 187 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GABARAPO95166 117 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EPOP01588 193 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QCP02747 245 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FUT4P22083 530 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXA9P31269 272 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF6P49848 677 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SQLEQ14534 574 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf89Q6UX73 402 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CASP10Q92851 521 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 QPCTLQ9NXS2 382 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51F1A6NGY5 319 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF839A8K0R7 811 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 F9P00740 461 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS56P0CW18 603 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ARL4AP40617 200 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC5A3P53794 718 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GP2P55259 537 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH13P55290 713 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF3Q13114 568 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPRYD7Q5W111 196 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF599Q96NL3 588 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VNN3Q9NY84 501 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPO11Q9Y5K1 396 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO7AQ13402 2215 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UBDO15205 165 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MATN1P21941 496 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TTLL4Q14679 1199 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AAK1Q2M2I8 961 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DPP9Q86TI2 863 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED2Q9BTP6 218 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PICK1Q9NRD5 415 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VAPAQ9P0L0 249 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 STAP1Q9ULZ2 295 aa3.62□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TET1Q8NFU7 2136 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GBF1Q92538 1859 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 E2F3O00716 465 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CREB3O43889 395 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPLA4P41247 253 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MVDP53602 400 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IST1P53990 364 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS26BQ4G0F5 336 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DDI1Q8WTU0 396 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF566Q969W8 418 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1191Q96A73 305 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MBOAT4Q96T53 435 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TASP1Q9H6P5 420 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PALMDQ9NP74 551 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DDIT4Q9NX09 232 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DOCK6Q96HP0 2047 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TREHO43280 583 aa3.61□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADRA2AP08913 450 aa3.61□□□□□ -1.83
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