RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411328.1

RN7SKP194-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 194, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP194, Length 351 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP194-201ENST00000411328 NUS1Q96E22 293 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 C14orf79Q96F83 325 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 CPXM1Q96SM3 734 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 SYNCQ9H7C4 482 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 FAM221AA4D161 298 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 E2F3O00716 465 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TIAF1O95411 115 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 EML2O95834 649 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 SLC2A4P14672 509 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 RHOQP17081 205 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TYRP1P17643 537 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 GM2AP17900 193 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 CETN1Q12798 172 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 LAMB3Q13751 1172 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 LRP8Q14114 963 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 PYCR3Q53H96 274 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 DENND2CQ68D51 928 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 IYDQ6PHW0 289 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 DPPA4Q7L190 304 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 SLC26A9Q7LBE3 791 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 LZTR1Q8N653 840 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 FAR1Q8WVX9 515 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TBCBQ99426 244 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 RETREG1Q9H6L5 497 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 SERPINA4P29622 427 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 GNA15P30679 374 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 FMO5P49326 533 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 PPP2R2AP63151 447 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TUBB3Q13509 450 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 CYTH1Q15438 398 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ASIC2Q16515 512 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ARTNQ5T4W7 220 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 MTFR2Q6P444 385 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 CEP97Q8IW35 865 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 WDTC1Q8N5D0 677 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ZBTB2Q8N680 514 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 AVL9Q8NBF6 648 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TMEM248Q9NWD8 314 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 LHX3Q9UBR4 397 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 OR12D3Q9UGF7 316 aa9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 RTTNQ86VV8 2226 aa9.46□□□□□ -0.89
RN7SKP194-201ENST00000411328 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 A0A0G2JNG1 304 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 A0A1W2PQJ5 194 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 LILRA5A6NI73 299 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 OR5K4A6NMS3 321 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 CCL21O00585 134 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 SNX2O60749 519 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 JRKO75564 520 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 UBXN7O94888 489 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 ERBB2P04626 1255 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 MYL1P05976 194 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 SYT1P21579 422 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 FECHP22830 423 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 CA5AP35218 305 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 GPR1P46091 355 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 GCNT1Q02742 428 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 ATP1A4Q13733 1029 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 MYBPC3Q14896 1274 aa9.46□□□□□ -0.9
RN7SKP194-201ENST00000411328 KIR2DS5Q14953 304 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms