RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411292.1

SNORD71-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 71, humanhuman

BASIC

Gene SNORD71, Length 86 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ZIC3O60481 467 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 DOK2O60496 412 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 KCNJ13O60928 360 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 MITFO75030 526 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ENTPD3O75355 529 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 JRKO75564 520 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 KRT36O76013 467 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 GCNT3O95395 438 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CLDN14O95500 239 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 WDPCPO95876 746 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 BMP15O95972 392 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TSHBP01222 138 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 IL1AP01583 271 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 IGHV4-39P01824 125 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 DANCRP0C864 163 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CFC1BP0CG36 223 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CFC1P0CG37 223 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 FAM106CPP0CH98 169 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 IRF1P10914 325 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 UBL4AP11441 157 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 FGF5P12034 268 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ACTN1P12814 892 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 SRCP12931 536 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 GP1BBP13224 206 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 SLC2A4P14672 509 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 GM2AP17900 193 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TNFAIP3P21580 790 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ANOS1P23352 680 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 BDNFP23560 247 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 DGKAP23743 735 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 MCM3P25205 808 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CIITAP33076 1130 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 AHRP35869 848 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 PGM1P36871 562 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 MMP14P50281 582 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CLCN3P51790 818 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CLCN5P51795 746 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 FUT6P51993 359 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CDH15P55291 814 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TMPRSS3P57727 454 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 B3GALT5-AS1P59052 145 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TAS2R38P59533 333 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ERVFC1-1P60608 527 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 RPP30P78346 268 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 RELQ04864 619 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 SLC20A2Q08357 652 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ARL16Q0P5N6 197 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 EPS8Q12929 822 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 MYBPHQ13203 477 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 PRKG2Q13237 762 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TDGQ13569 410 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TNFAIP1Q13829 316 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CAPSQ13938 189 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 PCLAFQ15004 111 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TAF11Q15544 211 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CCNG2Q16589 344 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CALCRLQ16602 461 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 NFIL3Q16649 462 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 DPCR1Q3MIW9 517 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF718Q3SXZ3 478 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF585BQ52M93 769 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 ZNF805Q5CZA5 627 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 FSCBQ5H9T9 825 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 RAB41Q5JT25 222 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 KCNT1Q5JUK3 1230 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 DCST1Q5T197 706 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 LRIF1Q5T3J3 769 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 STXBP5Q5T5C0 1151 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 FAM69AQ5T7M9 428 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 SUSD4Q5VX71 490 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 GGNBP1Q5YKI7 109 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 FAM205BPQ63HN1 556 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 NADSYN1Q6IA69 706 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 TTI2Q6NXR4 508 aa0.45□□□□□ -2.34
SNORD71-201ENST00000411292 SARM1Q6SZW1 724 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms