RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ZBED1O96006 694 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GLUD1P00367 558 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 F9P00740 461 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 KRT14P02533 472 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CD48P09326 243 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RARGP13631 454 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HTR7P34969 479 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HSD17B3P37058 310 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MAGEA11P43364 429 aa6.67□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 SLC5A3P53794 718 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PMS2P54278 862 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PLTPP55058 493 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RAC3P60763 192 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ADCY2Q08462 1091 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FOXE3Q13461 319 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SNX1Q13596 522 aa6.67□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 CCDC142Q17RM4 750 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RNF151Q2KHN1 245 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM153CQ494X1 144 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DENND2CQ68D51 928 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 C4orf22Q6V702 233 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZS52 159 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZSN1 163 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PCGF5Q86SE9 256 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IQCKQ8N0W5 287 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DEFB106AQ8N104 65 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HASPINQ8TF76 798 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 P3H4Q92791 437 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RTP4Q96DX8 246 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 C8orf48Q96LL4 319 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZIM3Q96PE6 472 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RNF157Q96PX1 679 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MARCH5Q9NX47 278 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZNF148Q9UQR1 794 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RAD54BQ9Y620 910 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 F8W810 466 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 H7C4K7 107 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 I3L4J1 428 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 AGPSO00116 658 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SGK1O00141 431 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TGM5O43548 720 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BEST1O76090 585 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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CCL20-202ENST00000409189 IGLV3-25P01717 112 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IVLP07476 585 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ABHD2P08910 425 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MYZAPP0CAP1 466 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RBP3P10745 1247 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CYP2F1P24903 491 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IVDP26440 423 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ADCY8P40145 1251 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ITGA8P53708 1063 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CACNA2D1P54289 1103 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DYNLT1P63172 113 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DEUP1Q05D60 604 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZNF844Q08AG5 666 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 XRCC4Q13426 336 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NFYCQ13952 458 aa6.66□□□□□ -1.34
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