RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 SLCO1B7G3V0H7 640 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CLOCKO15516 846 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CHRM3P20309 590 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 STX1BP61266 288 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 RGS21Q2M5E4 152 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ZBED5Q49AG3 693 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TBCELQ5QJ74 424 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 HECTD2Q5U5R9 776 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TTC9BQ8N6N2 239 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 RDH11Q8TC12 318 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 FBXO32Q969P5 355 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CYP2S1Q96SQ9 504 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM62Q9BVG3 475 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 HIPK3Q9H422 1215 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TBC1D13Q9NVG8 400 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 OSER1Q9NX31 292 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 MATN1P21941 496 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ARSDP51689 593 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PFKFB4Q16877 469 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 KDM1BQ8NB78 822 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CALML6Q8TD86 181 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 BIRC8Q96P09 236 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 SERPINB11Q96P15 392 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 BPTFQ12830 3046 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 KRBA1A5PL33 1030 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ELK4P28324 431 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 POU4F1Q01851 419 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 KCNA10Q16322 511 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 GIPC2Q8TF65 315 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 IL12RB2Q99665 862 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PIK3R6Q5UE93 754 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 FAM171BQ6P995 826 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 RANBP10Q6VN20 620 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ABI1Q8IZP0 508 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ADI1Q9BV57 179 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 MARCH7Q9H992 704 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 GID8Q9NWU2 228 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ARL5AQ9Y689 179 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 A8MT66 165 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 RAMP2O60895 175 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 NCK1P16333 377 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ATP6V1B2P21281 511 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PAX3P23760 479 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CYP2C18P33260 490 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PBX3P40426 434 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 TRPV1Q8NER1 839 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 BHMTQ93088 406 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 FANCEQ9HB96 536 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 A0A0U1RQF3 1178 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 EI24O14681 340 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-206ENST00000405546 RAD23AP54725 363 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms