RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 SYNPOQ8N3V7 929 aa23.17■■□□□ 1.3
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CNN3-202ENST00000394202 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa23.17■■□□□ 1.3
CNN3-202ENST00000394202 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.17■■□□□ 1.3
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CNN3-202ENST00000394202 H0Y858 1186 aa23.16■■□□□ 1.3
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CNN3-202ENST00000394202 ZNF398Q8TD17 642 aa23.16■■□□□ 1.3
CNN3-202ENST00000394202 NAT14Q8WUY8 206 aa23.16■■□□□ 1.3
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CNN3-202ENST00000394202 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.16■■□□□ 1.3
CNN3-202ENST00000394202 ABCG8Q9H221 673 aa23.16■■□□□ 1.3
CNN3-202ENST00000394202 RHOJQ9H4E5 214 aa23.16■■□□□ 1.3
CNN3-202ENST00000394202 CAB39LQ9H9S4 337 aa23.16■■□□□ 1.3
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CNN3-202ENST00000394202 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.15■■□□□ 1.3
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CNN3-202ENST00000394202 CD151P48509 253 aa23.15■■□□□ 1.3
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CNN3-202ENST00000394202 ZNF549Q6P9A3 640 aa23.14■■□□□ 1.29
CNN3-202ENST00000394202 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.14■■□□□ 1.29
CNN3-202ENST00000394202 PJA1Q8NG27 643 aa23.14■■□□□ 1.29
CNN3-202ENST00000394202 DTD2Q96FN9 168 aa23.14■■□□□ 1.29
CNN3-202ENST00000394202 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CNN3-202ENST00000394202 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa23.13■■□□□ 1.29
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CNN3-202ENST00000394202 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.13■■□□□ 1.29
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CNN3-202ENST00000394202 MT-ND3P03897 115 aa23.12■■□□□ 1.29
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