RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389993.7

PSME4-201, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PSME4, Length 6,581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-201ENST00000389993 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PANX1Q96RD7 426 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CREBZFQ9NS37 354 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 CDH4P55283 916 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 RNF186Q9NXI6 227 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.52□□□□□ -0.08
PSME4-201ENST00000389993 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FAM149AA5PLN7 773 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 NIPSNAP2O75323 286 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 NDST3O95803 873 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FOXN2P32314 431 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MADCAM1Q13477 382 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ALG2Q9H553 416 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 A0A0U1RQF3 1178 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 A0A0U1RQS6 177 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FKBP6O75344 327 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CNMDO75829 334 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 F2P00734 622 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 EDN1P05305 212 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PRKCQQ04759 706 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SQLEQ14534 574 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MAPK11Q15759 364 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 C1orf220Q5T0J3 134 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ZBTB2Q8N680 514 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 VPS33AQ96AX1 596 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 AP2M1Q96CW1 435 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 AP4S1Q9Y587 144 aa14.52□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 OR4F21O95013 312 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FTH1P02794 183 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 C19orf60Q96EN9 201 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ZW10O43264 779 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CHRNA1P02708 482 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SPESP1Q6UW49 350 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CYP4Z1Q86W10 505 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 BTAF1O14981 1849 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MYH10P35580 1976 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 GPR32O75388 356 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 HLA-EP13747 358 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MAP3K10Q02779 954 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SH3GL1Q99961 368 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 BCO2Q9BYV7 579 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 A0A1B0GVM2 712 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 IRAK2O43187 625 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 GJB5O95377 273 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TMEM198Q66K66 360 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FBXL18Q96ME1 805 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 YIPF1Q9Y548 306 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PPP2R1BP30154 601 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 Q6ZVU0 165 aa14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MAGEC1O60732 1142 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 MLYCDO95822 493 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TAS2R39P59534 338 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 TEAD2Q15562 447 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 PTPN2P17706 415 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 LMO3Q8TAP4 145 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 IRGQQ8WZA9 623 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 IPPKQ9H8X2 491 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SAR1AQ9NR31 198 aa14.5□□□□□ -0.09
PSME4-201ENST00000389993 SERPINA6P08185 405 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms