RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 PTPN5P54829 565 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB16Q05516 673 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 SYT13Q7L8C5 426 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 PGBD3Q8N328 593 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 EDAQ92838 391 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 ASB8Q9H765 288 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 DCXO43602 365 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 MMP20O60882 483 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 PCDH8O95206 1070 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 C6P13671 934 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 GABRB3P28472 473 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 DGKEP52429 567 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 LIMK2P53671 638 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 TAS2R38P59533 333 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 NFATC2Q13469 925 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 CHRNA6Q15825 494 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 TLCD1Q96CP7 247 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 VPS39Q96JC1 886 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 OSBPL6Q9BZF3 934 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 RHOJQ9H4E5 214 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 RAD18Q9NS91 495 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 PLXNA2O75051 1894 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 WNT9AO14904 365 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 TSPAN6O43657 245 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 AP1G1O43747 822 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 HAUS5O94927 633 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 GABRG2P18507 467 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF789Q5FWF6 425 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 SNX20Q7Z614 316 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 MZB1Q8WU39 189 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 SCAMP4Q969E2 229 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 MTBPQ96DY7 904 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA16Q9BXB7 569 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXA4-201ENST00000360046 HMX2A2RU54 273 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 RGSL1A5PLK6 1076 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 NDUFS3O75489 264 aa21.76■■□□□ 1.07
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HOXA4-201ENST00000360046 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 TRABD2AQ86V40 505 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 FAM124AQ86V42 546 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF398Q8TD17 642 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 CLDN23Q96B33 292 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 COQ10AQ96MF6 247 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 A0A1W2PPM1 405 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 PFDN6O15212 129 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 UGT1A6P19224 532 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 UGT1A1P22309 533 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 UGT1A4P22310 534 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 UGT1A3P35503 534 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 UGT1A5P35504 534 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 USP30Q70CQ3 517 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 GALNT7Q86SF2 657 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 KBTBD6Q86V97 674 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 TSTD1Q8NFU3 115 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 DTD2Q96FN9 168 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 TCF12Q99081 682 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 CDH19Q9H159 772 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
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HOXA4-201ENST00000360046 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 BDP1A6H8Y1 2624 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 PRR23AA6NEV1 266 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 GM2AP17900 193 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 HPDP32754 393 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 ITGA9Q13797 1035 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF284Q2VY69 593 aa21.75■■□□□ 1.07
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