RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 CXorf40AQ8TE69 158 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 S100A13Q99584 98 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 COX16Q9P0S2 106 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 HMGN1P05114 100 aa4.9□□□□□ -1.62
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PTPRD-201ENST00000355233 SUV39H1O43463 412 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 BPGMP07738 259 aa4.9□□□□□ -1.63
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PTPRD-201ENST00000355233 GKP32189 559 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ATP12AP54707 1039 aa4.9□□□□□ -1.63
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