RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324727.8

SCN4B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN4B, Length 4,484 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4B-201ENST00000324727 NFS1Q9Y697 457 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 A0A1W2PRU2 124 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SNTNA6NMZ2 147 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 F2P00734 622 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PGAM1P18669 254 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GPC1P35052 558 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SLC26A3P40879 764 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CNSTQ6PJW8 725 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF540Q8NDQ6 660 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FNDC8Q8TC99 324 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ING3Q9NXR8 418 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SAGE2PA6NJ88 616 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TOR1BO14657 336 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TCF4P15884 667 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GJA5P36382 358 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CA9Q16790 459 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PFKFB4Q16877 469 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FBXO39Q8N4B4 442 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CBR4Q8N4T8 237 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ACMSDQ8TDX5 336 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C19orf60Q96EN9 201 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LHX5Q9H2C1 402 aa11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ALDH1A2O94788 518 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GABRB2P47870 512 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 NPY2RP49146 381 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 BCAP31P51572 246 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ADGRE1Q14246 886 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MON1BQ7L1V2 547 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ADHFE1Q8IWW8 467 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PLD5Q8N7P1 536 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF366Q8N895 744 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 METTL6Q8TCB7 284 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZIC5Q96T25 663 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 NPAS2Q99743 824 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CPNE1Q99829 537 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF670Q9BS34 389 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MID1IP1Q9NPA3 183 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PTGIRP43119 386 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 GPR15P49685 360 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 VEGFBP49765 207 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 INSCQ1MX18 579 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RAB43Q86YS6 212 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 FBXO30Q8TB52 745 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SERAC1Q96JX3 654 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 VAT1Q99536 393 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ACBD6Q9BR61 282 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 C12orf4Q9NQ89 552 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KRT87PA6NCN2 255 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 E7ENX8 843 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 LBX1P52954 281 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TXNDC8Q6A555 127 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PLET1Q6UQ28 207 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SLC22A9Q8IVM8 553 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ZNF224Q9NZL3 707 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ING4Q9UNL4 249 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 PTPRJQ12913 1337 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 A0A0J9YVX5 310 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 MAGEB16A2A368 324 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 HACD1B0YJ81 288 aa11.62□□□□□ -0.55
SCN4B-201ENST00000324727 ATP6AP2O75787 350 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms