RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 PDHA1P08559 390 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ITGB7P26010 798 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SLC8A1P32418 973 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 MAGEA3P43357 314 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 BRD3Q15059 726 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 BBS9Q3SYG4 887 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 USP45Q70EL2 814 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SAP25Q8TEE9 199 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 VOPP1Q96AW1 172 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 LRRC39Q96DD0 335 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CRELD1Q96HD1 420 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 IL22Q9GZX6 179 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 HACD3Q9P035 362 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 AK5Q9Y6K8 562 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 IGSF10Q6WRI0 2623 aa15.94■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 A0A1W2PR77 199 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SDR42E2A6NKP2 422 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 E7ESA3 106 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 MYBL2P10244 700 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 C5AR1P21730 350 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 MGAT1P26572 445 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ACADVLP49748 655 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SUOXP51687 545 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 DNAJC3Q13217 504 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 LAMB3Q13751 1172 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SLMAPQ14BN4 828 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SHBQ15464 509 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 QPCTQ16769 361 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 FNBP1LQ5T0N5 605 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ARMC3Q5W041 872 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 EMBQ6PCB8 327 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 OXR1Q8N573 874 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 EID2Q8N6I1 236 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 OR14C36Q8NHC7 312 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 PIH1D2Q8WWB5 315 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SERAC1Q96JX3 654 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 EBF2Q9HAK2 575 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SAYSD1Q9NPB0 183 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SARDHQ9UL12 918 aa15.93■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 MYLKQ15746 1914 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 A0A0J9YYE9 177 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CCDC151A5D8V7 595 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CAPN8A6NHC0 703 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 RRP8O43159 456 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 AVILO75366 819 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 TRBC1P01850 177 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 NEK3P51956 506 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SEMG2Q02383 582 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CBLBQ13191 982 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 MTM1Q13496 603 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ERAP2Q6P179 960 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CASC4Q6P4E1 433 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ARRDC3Q96B67 414 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 PWWP2AQ96N64 755 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 NRSN2Q9GZP1 204 aa15.92■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 MAGEB16A2A368 324 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 HEATR9A2RTY3 570 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 TK2O00142 265 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 TLR4O00206 839 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 FAM153BP0C7A2 387 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 TPH1P17752 444 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CTPS1P17812 591 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ITPKBP27987 946 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ADPRHP54922 357 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CLDN6P56747 220 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 NXPH1P58417 271 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 ILKQ13418 452 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 SEPT6Q14141 434 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 POU6F1Q14863 301 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 UGP2Q16851 508 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 FAM153CQ494X1 144 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 MSS51Q4VC12 460 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 CCDC38Q502W7 563 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 PCID2Q5JVF3 399 aa15.91■□□□□ 0.14
IFT20-201ENST00000322326 HES3Q5TGS1 186 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms