RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321407.2

GCC1-201, Transcript of GRIP and coiled-coil domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCC1, Length 4,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1-201ENST00000321407 GSTCDQ8NEC7 633 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 WDR47O94967 919 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SHHQ15465 462 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FAM171BQ6P995 826 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 OR2AG1Q9H205 316 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SOX13Q9UN79 622 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 A0A1W2PQ67 120 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 LCHNA4D1U4 455 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 H3BM21 787 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 RRM2BQ7LG56 351 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 COL26A1Q96A83 441 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 WDR41Q9HAD4 459 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SPHK2Q9NRA0 654 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 PNPOQ9NVS9 261 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TIMM22Q9Y584 194 aa14.6□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 H3BMM5 538 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 MMP20O60882 483 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 NTRK1P04629 796 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 PRIM2P49643 509 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TNK2Q07912 1038 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 Q6ZVL8 140 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 APCDD1Q8J025 514 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 LEMD2Q8NC56 503 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SCAMP4Q969E2 229 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SLC22A12Q96S37 553 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 DPY30Q9C005 99 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FAM189A1O60320 539 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FTH1P02794 183 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 HOXB2P14652 356 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 CREB5Q02930 508 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TAGAPQ8N103 731 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 RNF38Q9H0F5 515 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 A0A087X1B8 175 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 C9JVG2 144 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ELP6Q0PNE2 266 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SERINC3Q13530 473 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 MARCH5Q9NX47 278 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.59□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 LAMB1P07942 1786 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FBXW4P57775 412 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TSNQ15631 228 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 MTSS1LQ765P7 747 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SNX32Q86XE0 403 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 LZICQ8WZA0 190 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 FAR2Q96K12 515 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 SH3GL3Q99963 347 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TRIM15Q9C019 465 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 Q9H521 79 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ZNF711Q9Y462 761 aa14.58□□□□□ -0.07
GCC1-201ENST00000321407 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.58□□□□□ -0.08
GCC1-201ENST00000321407 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms