RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 CD86P42081 329 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ITKQ08881 620 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 RPS6KA2Q15349 733 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 LDLRAP1Q5SW96 308 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 KIAA2013Q8IYS2 634 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 OR6J1Q8NGC5 347 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 NUDT8Q8WV74 236 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 TSPAN17Q96FV3 270 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 CD320Q9NPF0 282 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 RGS18Q9NS28 235 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 NR4A1P22736 598 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 RXRGP48443 463 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 CLCNKBP51801 687 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ITIH5Q86UX2 942 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 VTA1Q9NP79 307 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 NT5MQ9NPB1 228 aa25.21■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ZNF33AQ06730 810 aa25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 GALNT18Q6P9A2 607 aa25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 SNX19Q92543 992 aa25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 HACD3Q9P035 362 aa25.2■■□□□ 1.63
SENP3-201ENST00000321337 ADAM23O75077 832 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PRSS56P0CW18 603 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 DSC2Q02487 901 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 KANK2Q63ZY3 851 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 OR13F1Q8NGS4 319 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MYLPFQ96A32 169 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 IKZF3Q9UKT9 509 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CEP350Q5VT06 3117 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GPIP06744 558 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TCF3P15923 654 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 HRH2P25021 359 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 HLCSP50747 726 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 BIRC7Q96CA5 298 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GID8Q9NWU2 228 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GPR45Q9Y5Y3 372 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 J3KR12 359 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 LBPP18428 481 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 UFM1P61960 85 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SEMA3AQ14563 771 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TBATAQ96M53 351 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 BCAP31P51572 246 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PIGFQ07326 219 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NR1D2Q14995 579 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MOGQ16653 247 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 BTLAQ7Z6A9 289 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CALML6Q8TD86 181 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 RNF145Q96MT1 663 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NEURL2Q9BR09 285 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 C1orf50Q9BV19 199 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CHID1Q9BWS9 393 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 MIOSQ9NXC5 875 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PKD2L2Q9NZM6 624 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SNAP91O60641 907 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PEX11BO96011 259 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CCNA2P20248 432 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 OR4D2P58180 307 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SLC10A7Q0GE19 358 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 ZNF354CQ86Y25 554 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 LHPPQ9H008 270 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 NTN4Q9HB63 628 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TREHO43280 583 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 FGF4P08620 206 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 PCNAP12004 261 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CYP2A13Q16696 494 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 XAF1Q6GPH4 301 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 CASP10Q92851 521 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 GLT1D1Q96MS3 346 aa25.17■■□□□ 1.62
SENP3-201ENST00000321337 RTP3Q9BQQ7 232 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms