RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 NPY2RP49146 381 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CRADDP78560 199 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PTK2BQ14289 1009 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINB12Q96P63 405 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ERP44Q9BS26 406 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 EDEM2Q9BV94 578 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 LGR4Q9BXB1 951 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 IL22Q9GZX6 179 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 DPH5Q9H2P9 285 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 IL26Q9NPH9 171 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GPR27Q9NS67 375 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 FKBPLQ9UIM3 349 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 FADS2P1A8MWK0 482 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 HTR1BP28222 390 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CDK3Q00526 305 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 LAMB3Q13751 1172 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 NFATC4Q14934 902 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 HLA-BQ31612 363 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 HOOK3Q86VS8 718 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 RANBP9Q96S59 729 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CARD6Q9BX69 1037 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TEX101Q9BY14 249 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GAREM1Q9H706 876 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SYBUQ9NX95 663 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 MROH6A6NGR9 719 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CCL22O00626 93 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 MLNP12872 115 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TEAD1P28347 426 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 HADHAP40939 763 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA8P53708 1063 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 MORF4L2Q15014 288 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PCID2Q5JVF3 399 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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HOXD4-201ENST00000306324 HIC2Q96JB3 615 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 RAB17Q9H0T7 212 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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HOXD4-201ENST00000306324 CER1O95813 267 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1024LP59773 190 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A5Q01650 507 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 FZD2Q14332 565 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CASC4Q6P4E1 433 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MACC1Q6ZN28 852 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM74Q86UV6 250 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PARGQ86W56 976 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 WDR92Q96MX6 357 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 IL21RQ9HBE5 538 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CHRAC1Q9NRG0 131 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 DNAJC28Q9NX36 388 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ANAPC5Q9UJX4 755 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 APPL1Q9UKG1 709 aa22.2■■□□□ 1.14
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HOXD4-201ENST00000306324 PRAMEF1O95521 474 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 KELP23276 732 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CALCOCO2Q13137 446 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CHRNA6Q15825 494 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 DOK6Q6PKX4 331 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 MPP5Q8N3R9 675 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 BBOF1Q8ND07 529 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF778Q96MU6 729 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 PIEZO1Q92508 2521 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP54Q96N23 3096 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM202A6NGA9 273 aa22.18■■□□□ 1.14
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