RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A12O75746 678 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MMP8P22894 467 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS26BQ4G0F5 336 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 EEF1DP3Q658K8 133 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SQORQ9Y6N5 450 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNKO75909 580 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDX6P30041 224 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IL18Q14116 193 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 OLFML2AQ68BL7 652 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 OTOP3Q7RTS5 596 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SGK2Q9HBY8 427 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEAL5Q5H9L2 206 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LDLRAP1Q5SW96 308 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 HELQQ8TDG4 1101 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MANFP55145 182 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3R6Q5UE93 754 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MON1BQ7L1V2 547 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FERD3LQ96RJ6 166 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.09■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD11O43934 449 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 FABP3P05413 133 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 THRBP10828 461 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX44Q53QW1 395 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PDPRQ8NCN5 879 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LRTM1Q9HBL6 345 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CSH1P0DML2 217 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CSH2P0DML3 217 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 PLK4O00444 970 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGB5P18084 799 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 VGLL4Q14135 290 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP69Q49AA0 526 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTD1Q8N815 330 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TSSK3Q96PN8 268 aa24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN9O75954 239 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT1A5P35504 534 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GNPDA1P46926 289 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 HM13Q8TCT9 377 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CPXM1Q96SM3 734 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LGALS13Q9UHV8 139 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa24.08■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 NOL4O94818 638 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AMD1P17707 334 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AQP1P29972 269 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CLK3P49761 638 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PIK3C3Q8NEB9 887 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO19Q96H55 970 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF180Q9UJW8 692 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 STX16O14662 325 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RGS20O76081 388 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DHFRP00374 187 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CXCR3P49682 368 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ERICH5Q6P6B1 374 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB23Q9ULC3 237 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 DHRS7Q9Y394 339 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PRG6 482 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GSAPA4D1B5 854 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNGP01579 166 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PAX3P23760 479 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ITPKAP23677 461 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKN2BP42772 138 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS9P46781 194 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 SEPHS1P49903 392 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 ARF5P84085 180 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 LIPEQ05469 1076 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.07■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM149AA5PLN7 773 aa24.06■■□□□ 1.44
GNPTAB-201ENST00000299314 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms