RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 KLHL3Q9UH77 587 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.05■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1W2PQ67 120 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MAP3K6O95382 1288 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 LHCGRP22888 699 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 HTR7P34969 479 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MAPK9P45984 424 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 GPR1P46091 355 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 RENBPP51606 427 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 IL10RBQ08334 325 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 LRP8Q14114 963 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF787Q6DD87 383 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 Q6ZVL8 140 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NCSTNQ92542 709 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF31Q96EP0 1072 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CROTQ9UKG9 612 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.04■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PSMD11O00231 422 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ERCC2P18074 760 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DCTP40126 519 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 EPHA4P54764 986 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 HHEXQ03014 270 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF235Q14590 738 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CA9Q16790 459 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TRIM74Q86UV6 250 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 LZTR1Q8N653 840 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PSKH2Q96QS6 385 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TSPY26PQ9H489 355 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CD84Q9UIB8 345 aa16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ABCA12Q86UK0 2595 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CDC14CA4D256 554 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SOCS5O75159 536 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PDGFAP04085 211 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 FURINP09958 794 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF224P0DH78 156 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 JAM2P57087 298 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TYRO3Q06418 890 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DPTQ07507 201 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NFATC2Q13469 925 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PTPRRQ15256 657 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 DPCR1Q3MIW9 517 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TCP11X2Q5H9J9 407 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 MON1BQ7L1V2 547 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TSPAN33Q86UF1 283 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 GALNT13Q8IUC8 556 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PLXDC1Q8IUK5 500 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 NPWQ8N729 165 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.02■□□□□ 0.16
CLEC1B-201ENST00000298527 ESPL1Q14674 2120 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A0U1RQS6 177 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 EPHB6O15197 1021 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 KATNA1O75449 491 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CREG1O75629 220 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 ASMTLO95671 621 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 EML2O95834 649 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 CTPS1P17812 591 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 OGDHQ02218 1023 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 TRAF2Q12933 501 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 SEMA5AQ13591 1074 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PYCR3Q53H96 274 aa16.01■□□□□ 0.15
CLEC1B-201ENST00000298527 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms