RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TFEBP19484 476 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 NR4A1P22736 598 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 HPCAL1P37235 193 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 BAG6P46379 1132 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 GRIA4P48058 902 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PSME3P61289 254 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PRAMEP78395 509 aa6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 ART3Q13508 389 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SLC14A2Q15849 920 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ZBTB6Q15916 424 aa6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CDH26Q8IXH8 852 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 FIBCD1Q8N539 461 aa6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 TTPALQ9BTX7 342 aa6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 A8MU76 341 aa6.28□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 CYP4F3Q08477 520 aa6.28□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 INAVAQ3KP66 663 aa6.28□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.28□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CASC4Q6P4E1 433 aa6.28□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.28□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 SPRED1Q7Z699 444 aa6.28□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.28□□□□□ -1.4
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