RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028679.10

Ell3-201, Transcript of RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ell3, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3-201ENSMUST00000028679 Vmn2r85G3UW56 850 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ift81O35594 676 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sstr4P49660 385 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 NxnP97346 435 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 CtscP97821 462 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam160a1Q505K2 1081 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cage1Q5IR70 849 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Naa25Q8BWZ3 972 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Wwp1Q8BZZ3 918 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Q8CC96 669 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tcf25Q8R3L2 676 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Lgals12Q91VD1 314 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 TriobpQ99KW3 2014 aa20.62■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pramef17A2ASJ1 475 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 NuggcD3YWJ0 796 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 MntO08789 591 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 PbsnO08976 174 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ech1O35459 327 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 P01807 119 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 HmgclP38060 325 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Upp1P52624 311 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 VegfcP97953 415 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cdkl4Q3TZA2 342 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam126aQ6P9N1 521 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ubtd2Q6PGH0 234 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Dhx33Q80VY9 698 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sfr1Q8BP27 319 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Q8CIL4 281 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Olfr478Q8VG04 314 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Elmod3Q91YP6 381 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cyp2c55Q9D816 490 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Olfr703Q9EPF5 319 aa20.61■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zfp952B0V2W4 504 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gm3526E9PZM0 191 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 SpnP15702 395 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 CryaaP24622 196 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Plk2P53351 682 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gjb5Q02739 271 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cog7Q3UM29 770 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pcnx4Q3UVY5 1174 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Casc4Q6P2L7 435 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Syt14Q7TN84 555 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Lancl3Q8CD19 420 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nox1Q8CIZ9 591 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Med17Q8VCD5 649 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc44a3Q921V7 656 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Prokr1Q9JKL1 393 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pkp3Q9QY23 797 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 VapbQ9QY76 243 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ak1Q9R0Y5 194 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pot1bH7BX60 640 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 NumblO08919 604 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Nrg3O35181 713 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Psmc3O88685 442 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 PfklP12382 780 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tcf3P15806 651 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 PpargP37238 505 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 AdslP54822 484 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Stmn2P55821 179 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam47cQ14BE7 430 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Q6PAC4 1279 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 PolnQ7TQ07 864 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 HadhaQ8BMS1 763 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Svs2Q8BS30 375 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tbc1d14Q8CGA2 694 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pbld2Q9CXN7 288 aa20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Sppl2cA2A6C4 690 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gm11758A2BEI6 360 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gm11757A2BEI8 360 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Prrg1A2BFE8 218 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Vmn2r14E9Q759 848 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Traf2P39429 501 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 AdprhP54923 362 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 ThraP63058 492 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ext2P70428 718 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 LchnQ3UHG7 455 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Fam107aQ78TU8 144 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Abi3Q8BYZ1 367 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cabcoco1Q8CDT7 208 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Ssx2ipQ8VC66 615 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Olfr1019Q8VGS3 310 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rev1Q920Q2 1249 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Cul3Q9JLV5 768 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 DnpepQ9Z2W0 473 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Gm10715J3QP74 227 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Pag1Q3U1F9 429 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Arhgap17Q3UIA2 846 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 9930111J21Rik1Q5SVP0 844 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Tnfaip2Q61333 691 aa20.59■□□□□ 0.89
Ell3-201ENSMUST00000028679 Rps27lQ6ZWY3 84 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.8 ms