RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	TBX18	O95935	607 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MLN	P12872	115 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CCNA2	P20248	432 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TUBA3C	Q13748	450 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF846	Q147U1	533 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C14orf80	Q86SX3	495 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FAM47B	Q8NA70	645 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM169	Q96HH4	297 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	VAT1	Q99536	393 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EMCN	Q9ULC0	261 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IFT52	Q9Y366	437 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LAG3	P18627	525 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CAMK2B	Q13554	666 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM199	Q8N511	208 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TSGA13	Q96PP4	275 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF347	Q96SE7	839 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		15.31	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC12A8	A0AV02	714 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HMX2	A2RU54	273 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CARNS1	A5YM72	827 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	WASH4P	A8MWX3	477 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AKAP10	O43572	662 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KLHL41	O60662	606 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZMPSTE24	O75844	475 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CLPX	O76031	633 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HSPA4L	O95757	839 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BCL10	O95999	233 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BMP2	P12643	396 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CCNC	P24863	283 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GRIA1	P42261	906 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PRKAA2	P54646	552 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MS4A2	Q01362	244 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NFATC3	Q12968	1075 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PEX6	Q13608	980 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MIB1	Q86YT6	1006 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NRBF2	Q96F24	287 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SPG21	Q9NZD8	308 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPW3	197 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DFFA	O00273	331 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ABLIM3	O94929	683 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SEC24A	O95486	1093 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ACR	P10323	421 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KCNA4	P22459	653 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GABRB3	P28472	473 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PTK2B	Q14289	1009 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RAB39A	Q14964	217 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CYP2A13	Q16696	494 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TPGS2	Q68CL5	300 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DPF3	Q92784	378 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ACD	Q96AP0	544 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HMG20A	Q9NP66	347 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FNIP2	Q9P278	1114 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CPQ	Q9Y646	472 aa		15.29	■□□□□ 0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NUP205	Q92621	2012 aa		15.29	■□□□□ 0.04

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