RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629909.2

PCBP1-AS1-354, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 807 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CASQ1P31415 396 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 COILP38432 576 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PAFAH1B1P43034 410 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 GRK6P43250 576 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ID4P47928 161 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 KCNJ1P48048 391 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RXRGP48443 463 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 BLKP51451 505 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 DCDC1P59894 354 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 BASP1P80723 227 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CDK3Q00526 305 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PDE1BQ01064 536 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 OLIG2Q13516 323 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SEMA5AQ13591 1074 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 FZD2Q14332 565 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CDKN3Q16667 212 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 KCTD11Q693B1 232 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PDPK2PQ6A1A2 396 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RANBP10Q6VN20 620 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 NLRP8Q86W28 1048 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 NAXDQ8IW45 347 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 BTN2A2Q8WVV5 523 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SCAMP4Q969E2 229 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SLC32A1Q9H598 525 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PKP3Q9Y446 797 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 OR1A2Q9Y585 309 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.71□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PTPRBP23467 1997 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 C2orf81A6NN90 581 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 K7ESM1 405 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SDC3O75056 442 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PPFIA2O75334 1257 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SUN1O94901 812 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RASGRP1O95267 797 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CRTAMO95727 393 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CSF2P04141 144 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ALPPL2P10696 532 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ETS1P14921 441 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 JUNDP17535 347 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RPL22P35268 128 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 HMGCLP35914 325 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TRIM23P36406 574 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SPAM1P38567 509 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PPARDQ03181 441 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 CDH17Q12864 832 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SPARCL1Q14515 664 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TPRG1LQ5T0D9 272 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ALS2CLQ60I27 953 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TTC27Q6P3X3 843 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PELI3Q8N2H9 469 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 OR56A4Q8NGH8 313 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 PDXPQ96GD0 296 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TBATAQ96M53 351 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RUNDC3BQ96NL0 473 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TEX101Q9BY14 249 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 SPASTQ9UBP0 616 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 RNF14Q9UBS8 474 aa8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PCBP1-AS1-354ENST00000629909 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms