RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC20A2Q08357 652 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CALCOCO2Q13137 446 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RETSATQ6NUM9 610 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 C4orf22Q6V702 233 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC14AQ86T13 490 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPTQ96BT3 561 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RTP4Q96DX8 246 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SNF8Q96H20 258 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SPON2Q9BUD6 331 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 EVA1BQ9NVM1 165 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 OR12D3Q9UGF7 316 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NAV2Q8IVL1 2488 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BM21 787 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAPO00193 183 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 EFSO43281 561 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 GNA12Q03113 381 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CLN3Q13286 438 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC31Q6UY01 552 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PLPP6Q8IY26 295 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND6BQ8NEG7 585 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC45Q96CN5 670 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CLPBQ9H078 707 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 DPH5Q9H2P9 285 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NDFIP2Q9NV92 336 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 COL12A1Q99715 3063 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 FPGTO14772 594 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TCEA3O75764 348 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 IGFALSP35858 605 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ACVRL1P37023 503 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY8P40145 1251 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP8Q14790 479 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NR0B2Q15466 257 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC24Q6UX98 284 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6K2Q8NGY2 324 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC61Q9BV99 259 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 ASIC3Q9UHC3 531 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 NEU3Q9UQ49 428 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 AREL1O15033 823 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MUSKO15146 869 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN6O43657 245 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 AMPD1P23109 780 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf61Q13536 156 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MANEALQ5VSG8 457 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PCGF5Q86SE9 256 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 MED8Q96G25 268 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FMO2Q99518 471 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTA1P02549 2419 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TPI1P60174 286 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP128Q6ZU80 1094 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB7BQ96AH8 199 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TBATAQ96M53 351 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 OLFM3Q96PB7 478 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 IL12RB2Q99665 862 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM118BQ9BPY3 351 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 RETREG1Q9H6L5 497 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 DONSONQ9NYP3 566 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 DTLQ9NZJ0 730 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 LMO7DNF2Z398 122 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CREB3O43889 395 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 ERCC2P18074 760 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PLTPP55058 493 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 SGCGQ13326 291 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-216ENST00000628306 PDK1Q15118 436 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms