RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 TAF8Q7Z7C8 310 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CPNE8Q86YQ8 564 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 NT5MQ9NPB1 228 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 AMACRQ9UHK6 382 aa22■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 LCMT1Q9UIC8 334 aa22■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 DPTQ07507 201 aa21.99■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 C14orf28Q4W4Y0 310 aa21.99■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 CCL4L1Q8NHW4 92 aa21.99■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 GPBAR1Q8TDU6 330 aa21.99■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa21.99■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.111e-12■■■■□ 25.3
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SRRT-218ENST00000620394 PRAMEF10O60809 474 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CEACAM5P06731 702 aa21.98■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 MAN1A1P33908 653 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF7Q14155 803 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 IHHQ14623 411 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 SLC18A3Q16572 532 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 TBR1Q16650 682 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa21.98■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 SPRED1Q7Z699 444 aa21.98■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 FAM46DQ8NEK8 389 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC7Q99615 494 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CMKLR1Q99788 373 aa21.98■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa21.98■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 MATN3O15232 486 aa21.97■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 SOD1P00441 154 aa21.97■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.97■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 SLC25A18Q9H1K4 315 aa21.97■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 A0A0J9YYE9 177 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 B4DGG1 531 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 TRBC1P01850 177 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 NTRK1P04629 796 aa21.96■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 PTMSP20962 102 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 CES1P23141 567 aa21.96■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 TRIM14Q14142 442 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 PTPRRQ15256 657 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 LRRC66Q68CR7 880 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 DENND2CQ68D51 928 aa21.96■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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SRRT-218ENST00000620394 RNF215Q9Y6U7 377 aa21.96■■□□□ 1.11
SRRT-218ENST00000620394 IVLP07476 585 aa21.95■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 CTPS1P17812 591 aa21.95■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 DSC2Q02487 901 aa21.95■■□□□ 1.1
SRRT-218ENST00000620394 TLE1Q04724 770 aa21.95■■□□□ 1.1
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