RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603651.1

TUBE1-205, Transcript of tubulin epsilon 1, human

TSL 3

Gene TUBE1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBE1-205	ENST00000603651	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	WDR1	O75083	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	POLB	P06746	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TERF1	P54274	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	GALNT2	Q10471	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	VCY	O14598	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TSPAN4	O14817	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	RAD23B	P54727	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FOXM1	Q08050	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	GPR68	Q15743	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PIGT	Q969N2	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	VEZT	Q9HBM0	779 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CD53	P19397	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	F2RL3	Q96RI0	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FTCD	O95954	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TAF6	P49848	677 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TAS2R38	P59533	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	CAMK1	Q14012	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TUBE1-205	ENST00000603651	PTPRC	P08575	1304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TUBE1-205	ENST00000603651	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TUBE1-205	ENST00000603651	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TUBE1-205	ENST00000603651	IL7R	P16871	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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