RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 GABRG3Q99928 467 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 HDAC8Q9BY41 377 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 FUT8Q9BYC5 575 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 CEP41Q9BYV8 373 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 SENP1Q9P0U3 644 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 STON1Q9Y6Q2 735 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0J9YYE9 177 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MROH6A6NGR9 719 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CAPN8A6NHC0 703 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 A6NNZ2 444 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 RIPK2O43353 540 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 AP1G1O43747 822 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FZD6O60353 706 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 KRT37O76014 449 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 KRT38O76015 456 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM63AO94886 807 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CD160O95971 181 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 GLDCP23378 1020 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 ECHS1P30084 290 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 OXTRP30559 389 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 HMGCLP35914 325 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 HSD17B3P37058 310 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ELK3P41970 407 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SLC6A11P48066 632 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 MAXP61244 160 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MGAT5Q09328 741 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 HYAL2Q12891 473 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GAB4Q2WGN9 574 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 STEAP4Q687X5 459 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT7Q86SF2 657 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TTC7BQ86TV6 843 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 LCA5Q86VQ0 697 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 TDRPQ86YL5 185 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 IQCKQ8N0W5 287 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 STK40Q8N2I9 435 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 PGBD5Q8N414 524 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ASB2Q96Q27 587 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.33□□□□□ -1.24
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SMAD4-210ENST00000590061 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 PKD2L2Q9NZM6 624 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 FZD4Q9ULV1 537 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CHKBQ9Y259 395 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.32□□□□□ -1.24
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC189A1A4V9 331 aa7.32□□□□□ -1.24
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