RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	VPS11	Q9H270	941 aa		15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	OCEL1	Q9H607	264 aa		15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	NDE1	Q9NXR1	346 aa		15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		15.4	■□□□□ 0.06
DDX39A-209	ENST00000589318	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	AP1G1	O43747	822 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SRC	P12931	536 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PSMA3	P25788	255 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CSNK1D	P48730	415 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SERPINB8	P50452	374 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	AP1S1	P61966	158 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DLG2	Q15700	870 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	AAGAB	Q6PD74	315 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	15.39	■□□□□ 0.05	4e-10	■■■■□ 21.2
DDX39A-209	ENST00000589318	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TBATA	Q96M53	351 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	EMCN	Q9ULC0	261 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	OR51F1	A6NGY5	319 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GSR	P00390	522 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TYK2	P29597	1187 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	VIPR2	P41587	438 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ASPH	Q12797	758 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PTPRR	Q15256	657 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	UGP2	Q16851	508 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM215	Q68D42	235 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	STYX	Q8WUJ0	223 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ASIC4	Q96FT7	647 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ASB16	Q96NS5	453 aa		15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR91	A4D1P6	747 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIM24	O15164	1050 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IL1B	P01584	269 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CYP17A1	P05093	508 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ANPEP	P15144	967 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GK	P32189	559 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IRX4	P78413	519 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HPCA	P84074	193 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ADRM1	Q16186	407 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	CALML6	Q8TD86	181 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FGF13	Q92913	245 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	IGFLR1	Q9H665	355 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXO10	Q9UK96	956 aa		15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	BIRC5	O15392	142 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	LINC01565	O15544	149 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	GLRA3	O75311	464 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	FSHR	P23945	695 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PGM1	P36871	562 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	PGGT1B	P53609	377 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	INHBC	P55103	352 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TMPRSS15	P98073	1019 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	HYAL1	Q12794	435 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	MED21	Q13503	144 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	DHCR24	Q15392	516 aa		15.37	■□□□□ 0.05
DDX39A-209	ENST00000589318	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	15.37	■□□□□ 0.05

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