RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	IFNL1	Q8IU54	200 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ANKFN1	Q8N957	763 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1191	Q96A73	305 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SLC12A8	A0AV02	714 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	UBXN8	O00124	270 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NR5A2	O00482	541 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PIP5K1B	O14986	540 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	VILL	O15195	856 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CSPG5	O95196	566 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TBX18	O95935	607 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	BMP2	P12643	396 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MTHFD2	P13995	350 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	IDO1	P14902	403 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	INHBE	P58166	350 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	FOXM1	Q08050	763 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	LCP2	Q13094	533 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GK3P	Q14409	553 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RPS6KA2	Q15349	733 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KCNA10	Q16322	511 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TCF12	Q99081	682 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	DERL2	Q9GZP9	239 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	18.37	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	C7orf72	A4D263	438 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR6C75	A6NL08	312 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SYCE1L	A8MT33	242 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	B4GALT3	O60512	393 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	HSD17B1	P14061	328 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ACVRL1	P37023	503 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	INPP5A	Q14642	412 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MTX3	Q5HYI7	312 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CST9	Q5W186	159 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.36	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	LCHN	A4D1U4	455 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GRIA3	P42263	894 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RAD51	Q06609	339 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GRIK2	Q13002	908 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT3	Q14435	633 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RETREG3	Q86VR2	466 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CARM1	Q86X55	608 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TRIB2	Q92519	343 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PDF	Q9HBH1	243 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RNF112	Q9ULX5	631 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC160	A6NGH7	325 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	RHOBTB1	O94844	696 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CLC	Q05315	142 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TAF10	Q12962	218 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA3A	Q14563	771 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KRT80	Q6KB66	452 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SNX31	Q8N9S9	440 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEH1	Q9H213	219 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	MAP10	Q9P2G4	905 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT3	Q9UH03	358 aa		18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
RRN3-205	ENST00000563559	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53

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