RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551157.6

TARBP2-216, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 1,008 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-216	ENST00000551157	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157		H3BRJ5	948 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	SLC28A2	O43868	658 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	SOCS5	O75159	536 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	PCK1	P35558	622 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	PBX1	P40424	430 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	MMP13	P45452	471 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	NR1I3	Q14994	352 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	TBR1	Q16650	682 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	FLNC	Q14315	2725 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	MAST4	O15021	2626 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157		A0A087X0T9	212 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	INPP4B	O15327	924 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	CPNE6	O95741	557 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	FAM228B	P0C875	321 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	KEL	P23276	732 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	RENBP	P51606	427 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	TAS2R40	P59535	323 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	EID2B	Q96D98	161 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-216	ENST00000551157		A0A1W2PQC6	194 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	CLDN7	O95471	211 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	HLA-DQB2	P05538	268 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	IVL	P07476	585 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	GJC1	P36383	396 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	ARL4A	P40617	200 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	ACTR1B	P42025	376 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	ACTR1A	P61163	376 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	DPYSL3	Q14195	570 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	PIM3	Q86V86	326 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	PQLC3	Q8N755	202 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	NKD1	Q969G9	470 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	COX14	Q96I36	57 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157		A0A0J9YYE9	177 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	DNAJC6	O75061	913 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	TRBC1	P01850	177 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	CYP1A2	P05177	515 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	MMP2	P08253	660 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	THRA	P10827	490 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	GPR1	P46091	355 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	STC1	P52823	247 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	LIMK2	P53671	638 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	CDH6	P55285	790 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	GBE1	Q04446	702 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	DPT	Q07507	201 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	GALNT2	Q10471	571 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	BOLA3	Q53S33	107 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	MANEA	Q5SRI9	462 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-216	ENST00000551157	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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