RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549340.5

LETMD1-218, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LETMD1, Length 818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF195O14628 629 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PER2O15055 1255 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RASSF9O75901 435 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RHOBTB1O94844 696 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PIGNO95427 931 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ESR1P03372 595 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SERPINA6P08185 405 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 T-ENOLP0DO92 83 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CD1DP15813 335 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PGGT1BP53609 377 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ATP6V0D1P61421 351 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NFKB2Q00653 900 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CDKN3Q16667 212 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SMIM14Q96QK8 99 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TTC1Q99614 292 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 DERL2Q9GZP9 239 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 POMKQ9H5K3 350 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TLE6Q9H808 572 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 DZANK1Q9NVP4 752 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PNPOQ9NVS9 261 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HGSO14964 777 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 VPS26AO75436 327 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SLC4A1P02730 911 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ASLP04424 464 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CTPS1P17812 591 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TFEBP19484 476 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CALB2P22676 271 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 IDH3AP50213 366 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NAGLUP54802 743 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NAA20P61599 178 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TUBB3Q13509 450 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF697Q5TEC3 545 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ISCA2Q86U28 154 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 VOPP1Q96AW1 172 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NSL1Q96IY1 281 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TRMOQ9BU70 441 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 OBP2AQ9NY56 170 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TMCO1Q9UM00 188 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NUMBLQ9Y6R0 609 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa14.59□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 A8MT66 165 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 MATN2O00339 956 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SMIM24O75264 130 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ADH1CP00326 375 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ALPIP09923 528 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PRSS56P0CW18 603 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 ITGALP20701 1170 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 PTPN4P29074 926 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 FMO4P31512 558 aa14.58□□□□□ -0.08
LETMD1-218ENST00000549340 HNF1BP35680 557 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms