RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, human

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC82-208	ENST00000545264	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	TTC14	Q96N46	770 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	NODAL	Q96S42	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264		A0A0B4J293	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	LINC01565	O15544	149 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	EGF	P01133	1207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	UMOD	P07911	640 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CDH1	P12830	882 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	IL7R	P16871	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	KCNA5	P22460	613 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	FUT6	P51993	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	OLR1	P78380	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PDE1B	Q01064	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	FOXM1	Q08050	763 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CCNG2	Q16589	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	STRA6	Q9BX79	667 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264		A0A1W2PRG0	241 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	SPINT2	O43291	252 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CREB3	O43889	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ICAM3	P32942	547 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	FASLG	P48023	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	BBS10	Q8TAM1	723 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ACOX2	Q99424	681 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCDC82-208	ENST00000545264		A0A1W2PS18	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	TGFB1I1	O43294	461 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	GRID2	O43424	1007 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	LMX1B	O60663	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	PAGE4	O60829	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	NKX2-2	O95096	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCDC82-208	ENST00000545264	SPARC	P09486	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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