RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 ACADVLP49748 655 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 PLD1Q13393 1074 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 IKBKEQ14164 716 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 PTK2BQ14289 1009 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 OR4D1Q15615 310 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 MMEL1Q495T6 779 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 TMEM126BQ8IUX1 230 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 C19orf60Q96EN9 201 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 SCOCQ9UIL1 159 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.09■□□□□ 0.17
ATG13-216ENST00000530500 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 IRF1P10914 325 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 GFAPP14136 432 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CLCN4P51793 760 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 STX1BP61266 288 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 SH3BP2P78314 561 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 ARF5P84085 180 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PFKFB4Q16877 469 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.165e-8■■■□□ 15.5
ATG13-216ENST00000530500 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 DEFB128Q7Z7B8 93 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 NPAS2Q99743 824 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 UNC93B1Q9H1C4 597 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 RNF112Q9ULX5 631 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 GBF1Q92538 1859 aa16.08■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 C2orf78A6NCI8 922 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 H0Y626 953 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 H3BMM5 538 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 H3BNX3 289 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 H7C0S8 307 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 UBXN8O00124 270 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 VPS26AO75436 327 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 TMCC1O94876 653 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CDK14O94921 469 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CEACAM7Q14002 265 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 AGKQ53H12 422 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 NCEH1Q6PIU2 408 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 GK5Q6ZS86 529 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PDSS2Q86YH6 399 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 GATA6Q92908 595 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 EXT2Q93063 718 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 TMEM169Q96HH4 297 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 SARDHQ9UL12 918 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 TMCO1Q9UM00 188 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 FAM50BQ9Y247 325 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 TRIM38O00635 465 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 AZIN1O14977 448 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 ADARP55265 1226 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CDH13P55290 713 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 RPL26P61254 145 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 RAB33AQ14088 237 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PTPRNQ16849 979 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 MID1IP1Q9NPA3 183 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 MED16Q9Y2X0 877 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.07■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 BRCA2P51587 3418 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CARNS1A5YM72 827 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PRRG1O14668 218 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 VPS4BO75351 444 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 CD160O95971 181 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PRSS56P0CW18 603 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 MC4RP32245 332 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 EPHB3P54753 998 aa16.06■□□□□ 0.16
ATG13-216ENST00000530500 PKNOX1P55347 436 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms