RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 SCAMP4Q969E2 229 aa23.95■■□□□ 1.42
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PTPRJ-205ENST00000527952 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa23.89■■□□□ 1.41
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PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa23.89■■□□□ 1.41
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