RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527397.1

RAB1B-202, Transcript of RAB1B, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RAB1B, Length 991 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1B-202ENST00000527397 ARHGEF7Q14155 803 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ZNF284Q2VY69 593 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TRIM69Q86WT6 500 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ASB12Q8WXK4 309 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CERS2Q96G23 380 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ABCG8Q9H221 673 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.05■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TNFRSF10AO00220 468 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 LATO43561 262 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GPR37L1O60883 481 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ZNF217O75362 1048 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 VAPBO95292 243 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SHBGP04278 402 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PRSS56P0CW18 603 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 OXTRP30559 389 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 DPTQ07507 201 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SEMA3AQ14563 771 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 LONRF1Q17RB8 773 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TSSK4Q6SA08 328 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 FAM124AQ86V42 546 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 HORMAD1Q86X24 394 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 C1orf210Q8IVY1 113 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PGBD3Q8N328 593 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PAF1Q8N7H5 531 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GPR150Q8NGU9 434 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 FBF1Q8TES7 1133 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 RLN3Q8WXF3 142 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SCAMP4Q969E2 229 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 AGAP2Q99490 1192 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 EBF2Q9HAK2 575 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PKP3Q9Y446 797 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.04■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 A0A1W2PQU0 124 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 WNT9AO14904 365 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GPR39O43194 453 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SEMA4FO95754 770 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SLC4A1P02730 911 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 IGHV4-34P06331 123 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 ERVK-10P10266 1014 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CD6P30203 668 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 AVPR2P30518 371 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SPAM1P38567 509 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CHRNA6Q15825 494 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 KCNMB4Q86W47 210 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PIANPQ8IYJ0 282 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PNPLA1Q8N8W4 532 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 OR4L1Q8NH43 312 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GANCQ8TET4 914 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CENPTQ96BT3 561 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CDH19Q9H159 772 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 EURLQ9NYK6 297 aa16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TBC1D3EA0A087X179 549 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 FADS2P1A8MWK0 482 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TBC1D3LB9A6J9 549 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 AXIN1O15169 862 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PIAS1O75925 651 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TM7SF2O76062 418 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 PCDH8O95206 1070 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 TBC1D3HP0C7X1 549 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 GABRB3P28472 473 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 MC4RP32245 332 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 CCR5P51681 352 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB1B-202ENST00000527397 MGAT5Q09328 741 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms