RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	FER	P16591	822 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	GAP43	P17677	238 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CD9	P21926	228 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CTSS	P25774	331 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ALDH9A1	P49189	494 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	TKTL1	P51854	596 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	INHBC	P55103	352 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SCAND1	P57086	179 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPC3	Q13507	836 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	NAA25	Q14CX7	972 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	TGIF1	Q15583	401 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PFKFB4	Q16877	469 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MPEG1	Q2M385	716 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MIER2	Q8N344	545 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR18	Q8N4B5	295 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	LEMD2	Q8NC56	503 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MVB12A	Q96EY5	273 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PREB	Q9HCU5	417 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	THSD1	Q9NS62	852 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	EXOC1	Q9NV70	894 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	YIPF1	Q9Y548	306 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM150B	A6NC51	233 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	POM121B	A6NF01	834 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNJ18	B7U540	433 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MCF2L	O15068	1137 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	THAP12	O43422	761 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	STX6	O43752	255 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	FMO6P	O60774	539 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PGM3	O95394	542 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	WNT1	P04628	370 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CDK4	P11802	303 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	RARG	P13631	454 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	GABRR2	P28476	465 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	GPR3	P46089	330 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ASMT	P46597	345 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	BRCC3	P46736	316 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	LIMS1	P48059	325 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CCT8	P50990	548 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ARFIP1	P53367	373 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CASP6	P55212	293 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	RBP5	P82980	135 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC6A3	Q01959	620 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	GBE1	Q04446	702 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB16	Q05516	673 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ADCY2	Q08462	1091 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	GRIK3	Q13003	919 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB17	Q13105	803 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	MAPK7	Q13164	816 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SGCG	Q13326	291 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SP140	Q13342	867 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP1R7	Q15435	360 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	UGCG	Q16739	394 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PABPC1-223	ENST00000523636	LSMEM2	Q8N112	164 aa		5.24	□□□□□ -1.57

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