RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516637.1

RNU6-405P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 405, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-405P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-405P-201ENST00000516637 GGT5P36269 586 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GTF2H2Q13888 395 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 FCN2Q15485 313 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM76AQ8TAV0 307 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC41A2Q96JW4 573 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 FUZQ9BT04 418 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 FKRPQ9H9S5 495 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-405P-201ENST00000516637 ANTXRLA6NF34 631 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 LDLRAD4O15165 306 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 GABRB2P47870 512 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 GNAQP50148 359 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF280DQ6N043 979 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 HMGCLL1Q8TB92 370 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 PIGTQ969N2 578 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ORAI1Q96D31 301 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 F2RL3Q96RI0 385 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 PPCSQ9HAB8 311 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 EGFP01133 1207 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 PAX1P15863 534 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 NR1D1P20393 614 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 CNTFP26441 200 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 FOXM1Q08050 763 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 CAMK1Q14012 370 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF234Q14588 700 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 TAF12Q16514 161 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF524Q96C55 264 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 QRFPRQ96P65 431 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 LITAFQ99732 161 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 MPP6Q9NZW5 540 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 PADI3Q9ULW8 664 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 PTPRCP08575 1304 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 SNAP23O00161 211 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 VCYO14598 125 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNHIT1O43257 154 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF883P0CG24 379 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ALDH4A1P30038 563 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 TAF6P49848 677 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 TERF1P54274 439 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 GALNT2Q10471 571 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 GPR68Q15743 365 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 COL28A1Q2UY09 1125 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 FRG2Q64ET8 278 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM171BQ6P995 826 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 BEST3Q8N1M1 668 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 CNBD1Q8NA66 436 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 OR5R1Q8NH85 324 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 KLHL29Q96CT2 875 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 APOPT1Q96IL0 206 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF354BQ96LW1 612 aa3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms