RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 GSTA3Q16772 222 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 USP41Q3LFD5 358 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CEP85LQ5SZL2 805 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 PLA2G4FQ68DD2 849 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 QSOX2Q6ZRP7 698 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 SLC26A9Q7LBE3 791 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 CMKLR1Q99788 373 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 LUZP4Q9P127 313 aa5.03□□□□□ -1.6
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC53A6NM62 1247 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 SLC22A3O75751 556 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 MYOD1P15172 320 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 ITGA2P17301 1181 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 ABCD1P33897 745 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 TERF1P54274 439 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.02□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 HTRA1Q92743 480 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 RNF125Q96EQ8 232 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 SYT17Q9BSW7 474 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 RRN3Q9NYV6 651 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa5.02□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 RRN3P2A6NIE6 340 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 LDLRAD4O15165 306 aa5.01□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 CFC1P0CG37 223 aa5.01□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 GRIK2Q13002 908 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 GTF2H2Q13888 395 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 FRG2Q64ET8 278 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 BRAT1Q6PJG6 821 aa5.01□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 PIGTQ969N2 578 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 WBP2Q969T9 261 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 ASAH2Q9NR71 780 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 SARDHQ9UL12 918 aa5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 NCAM2O15394 837 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 MMP14P50281 582 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 FOXM1Q08050 763 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 FGFBP1Q14512 234 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 PDSS1Q5T2R2 415 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 CADM4Q8NFZ8 388 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 TAAR2Q9P1P5 351 aa5□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 HAO1Q9UJM8 370 aa5□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 TNFSF14O43557 240 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 WDR1O75083 606 aa4.99□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 AMBPP02760 352 aa4.99□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 CPXCR1Q8N123 301 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 BEST3Q8N1M1 668 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.99□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.99□□□□□ -1.61
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PDE4D-221ENST00000514231 PRSS1P07477 247 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 XBP1P17861 261 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 ISL1P61371 349 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 NEXNQ0ZGT2 675 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 GAGE5Q13069 117 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 GAGE6Q13070 117 aa4.98□□□□□ -1.61
PDE4D-221ENST00000514231 DECR1Q16698 335 aa4.98□□□□□ -1.61
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