RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRIK4Q16099 956 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPRED1Q7Z699 444 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAC4Q86UU9 113 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 BEST2Q8NFU1 509 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TOP1MTQ969P6 601 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAML3Q96JK9 1138 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF145Q96MT1 663 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 VPS51Q9UID3 782 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 INVSQ9Y283 1065 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 VWA7Q9Y334 891 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GPR32O75388 356 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 IMPDH1P20839 514 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRKACGP22612 351 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 IL12AP29459 219 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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RAPGEF6-211ENST00000512611 SEMA3AQ14563 771 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MEP1AQ16819 746 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARMCX2Q7L311 632 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ABI1Q8IZP0 508 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRPV3Q8NET8 790 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF34Q969K3 372 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GALPQ9UBC7 116 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLG2Q9UHN1 485 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF225Q9UK10 706 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.83□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 KRBA1A5PL33 1030 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 UPK1AO00322 258 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTHFD2P13995 350 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RFC2P35250 354 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 HOXD12P35452 270 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAPGP40121 348 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 AGTR2P50052 363 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 HK2P52789 917 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLA2G16P53816 162 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP6V0D1P61421 351 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 LIPEQ05469 1076 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.82□□□□□ -1.32
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RAPGEF6-211ENST00000512611 C14orf80Q86SX3 495 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.82□□□□□ -1.32
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RAPGEF6-211ENST00000512611 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 BORCS5Q969J3 196 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 BIRC7Q96CA5 298 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDK15Q96Q40 435 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHID1Q9BWS9 393 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALG2Q9H553 416 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GLOD4Q9HC38 313 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MID2Q9UJV3 735 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFAF1Q9Y375 327 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM247A6NEH6 219 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRIM64BA6NI03 449 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SOBPA7XYQ1 873 aa6.82□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 J3KR12 359 aa6.82□□□□□ -1.32
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