RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509638.5

LIMCH1-211, Transcript of LIM and calponin homology domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMCH1, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMCH1-211ENST00000509638 FAM83DQ9H4H8 585 aa29.52■■■□□ 2.32
LIMCH1-211ENST00000509638 RAD18Q9NS91 495 aa29.52■■■□□ 2.32
LIMCH1-211ENST00000509638 SUSD2Q9UGT4 822 aa29.52■■■□□ 2.32
LIMCH1-211ENST00000509638 POM121BA6NF01 834 aa29.51■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 PPFIA2O75334 1257 aa29.51■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 GNSP15586 552 aa29.51■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 HOXD12P35452 270 aa29.51■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 DPP6P42658 865 aa29.51■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 DRG2P55039 364 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 HIF1AQ16665 826 aa29.51■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 CASC4Q6P4E1 433 aa29.51■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 MPLP40238 635 aa29.5■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 LAMB3Q13751 1172 aa29.5■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 FNBP1LQ5T0N5 605 aa29.5■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 CDH19Q9H159 772 aa29.5■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa29.5■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 CD38P28907 300 aa29.49■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 CHRAC1Q9NRG0 131 aa29.49■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 SAMD15Q9P1V8 674 aa29.49■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 FKBPLQ9UIM3 349 aa29.49■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 SDR42E2A6NKP2 422 aa29.48■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa29.48■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 OR13H1Q8NG92 308 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 OR13J1Q8NGT2 312 aa29.47■■■□□ 2.31
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LIMCH1-211ENST00000509638 SKIDA1Q1XH10 827 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 RABEPKQ7Z6M1 372 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 SIGLEC10Q96LC7 697 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa29.47■■■□□ 2.31
LIMCH1-211ENST00000509638 KIFC1Q9BW19 673 aa29.47■■■□□ 2.31
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