RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498694.1

CTPS1-212, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 599 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-212ENST00000498694 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PDK1Q15118 436 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 LLGL1Q15334 1064 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TTC27Q6P3X3 843 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 LINGO4Q6UY18 593 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF852Q6ZMS4 543 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF227Q86WZ6 799 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PGBD5Q8N414 524 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 USP33Q8TEY7 942 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FAM3CQ92520 227 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLCO2A1Q92959 643 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FAM131CQ96AQ9 280 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CLDN23Q96B33 292 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TADA1Q96BN2 335 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MS4A14Q96JA4 679 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TSGA13Q96PP4 275 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PSKH2Q96QS6 385 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 PNKPQ96T60 521 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 LGMNQ99538 433 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 IL12RB2Q99665 862 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 G6PC3Q9BUM1 346 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HEMGNQ9BXL5 484 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CIPCQ9C0C6 399 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 CDH19Q9H159 772 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 GBA3Q9H227 469 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 L2HGDHQ9H9P8 463 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SP110Q9HB58 689 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ELOVL2Q9NXB9 296 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 AMACRQ9UHK6 382 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 DNPEPQ9ULA0 475 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 MMP17Q9ULZ9 603 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 ZNF281Q9Y2X9 895 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.09□□□□□ -1.75
CTPS1-212ENST00000498694 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 PLXNA2O75051 1894 aa4.09□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 F5P12259 2224 aa4.09□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 A0A1W2PQF6 199 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 TSPAN11A1L157 253 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 PRR23AA6NEV1 266 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 C10orf142B7Z368 130 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 WASH3PC4AMC7 463 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 H0Y858 1186 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 CCDC188H7C350 402 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 SGK1O00141 431 aa4.08□□□□□ -1.76
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CTPS1-212ENST00000498694 RNF103O00237 685 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 CBX4O00257 560 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 DFFAO00273 331 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 AURKAO14965 403 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 MATN3O15232 486 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 ALOX15BO15296 676 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 MTSS1O43312 755 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 TBX1O43435 398 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 PI15O43692 258 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 CEP104O60308 925 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 PSPNO60542 156 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 OPHN1O60890 802 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 KATNA1O75449 491 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 GSRP00390 522 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 MT-CO1P00395 513 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 RBP3P10745 1247 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 TDGF1P13385 188 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 HOXB2P14652 356 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-212ENST00000498694 AOC1P19801 751 aa4.08□□□□□ -1.76
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