RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM86B1E9PN63 330 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NDUFS8O00217 210 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PROM1O43490 865 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FMO6PO60774 539 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PEX11AO75192 247 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 ECT2LQ008S8 904 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 TREM1Q9NP99 234 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 PROB1E7EW31 1015 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 PGLSO95336 258 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UTS2BQ765I0 119 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.681e-6■■■□□ 15.9
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RABGGTB-213ENST00000496055 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LEMD2Q8NC56 503 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 COG1Q8WTW3 980 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 TXN2Q99757 166 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX7Q9UNH6 387 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 B4E171 279 aa4.57□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 HBQ1P09105 142 aa4.57□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 PCGF2P35227 344 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NBL1P41271 181 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCR9P51686 369 aa4.57□□□□□ -1.68
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